维生素B2缺乏主要表现为眼睛口腔和皮肤的炎症反应，眼睛表现为怕光、流泪、视物模糊、球结膜充血、角膜周围血管增生；口腔表现为唇炎、口角炎、舌炎等；皮肤常见的脂溢性皮炎，多见于皮脂分泌旺盛部位如鼻翼喔窝、耳后、乳房下，腋下、腹股沟等处。

患处可出现轻度红斑，覆盖黄色脂状鳞片。维生素B2缺乏还可导致缺铁性贫血，影响生长发育，妊娠期缺乏可导致胎儿骨骼畸形。维生素B2溶解度小，肠道吸收有限，体内又不能大量储存，故几乎无毒性。