碘131主要是用于治疗原发性甲亢和甲状腺癌。碘131是放射性元素，所以会有一定的副作用。首先，如果过度治疗的话，可能引起放射性甲状腺炎，严重的话需要激素治疗。同时也有可能引起甲状腺功能减退，有的人需要终身药物治疗。其他的副作用包括颈部肿胀疼痛、食欲不正、恶心、呕吐，部分人还会引起白细胞、血小板减少，但多数都可以自行缓解。大剂量碘131还会引起眼干、流泪、口干。