CT检查正常，核磁共振不一定会正常。核磁共振有较高的软组织分辨率，尤其是在中枢神经系统的病灶，检出率明显优于CT。比如急性脑梗塞，CT有可能在24小时内都是正常，磁共振可以精确到六小时。各种的急性脑炎早期CT也可以正常，磁共振可以检查出。一些脑转移性肿瘤，病灶直径小的时候CT也可以是正常，磁共振也可以明确地检测出。