衣原体肺炎通常来说不是严重的疾病，甚至少数患者可没有症状，但是如果出现了并发症，比如合并脑炎，合并了格林巴利综合征，那么就是比较严重的情况。

所以患了衣原体肺炎以后，还是要积极地配合医生治疗，比如可以选用大环内酯类、氟喹诺酮类药物治疗，并且要积极地用药对症处理，比如控制发热、咳嗽、头疼等，以避免并发症的发生，一旦出现脑炎、格林巴利综合征等严重并发症，应及时治疗，以免出现严重后果。