羊水少所导致的缺氧主要有两方面的原因，这种情况下羊水少和缺氧并不是互为因果关系，而是同时受到了疾病因素的影响。例如胎儿畸形，尤其是泌尿系统畸形可以表现为羊水少，因为妊娠中晚期羊水的主要成分就是胎尿，但是泌尿系统畸形往往不是单独存在，还可以合并着其他器官的畸形。

这个时候胎儿缺氧也是常见并发症，胎盘功能不良，在过期妊娠、胎儿生长受限、妊娠期高血压疾病等因素存在时，可以导致胎盘功能减退，这时可以同时导致羊水少和胎儿缺氧同时存在。