深呼吸时如果出现肺右下方疼痛，这一般考虑到可能是呼吸系统有一些炎症病变存在导致，比如像右肺下部炎症性病变存在，或者是因为右下部有结核分枝杆菌感染肺结核，也可以引起在深呼吸时有不同程度的疼痛。

并且像一些其他的病变存在，比如像由外伤导致的肋间神经损伤，或者是有肋间内肌和肋间外肌不同程度的损伤，都可以在深呼吸时感觉右下方疼痛现象发生。所以在临床上具体是哪种因素引起深呼吸时右下方疼痛，需要结合每个患者的具体情况进行综合性的分析，才能够明确诊断。