呼吸困难、胸闷气短是否可以耐受肠镜的检查是需要结合患者具体病情的，比如慢阻肺支气管扩张，这些疾病都能够导致呼吸困难、胸闷气短的情况，这些疾病通常来说并不是做肠镜的绝对禁忌。

但是在做肠镜之前是需要评估患者病情的，如果患者的肺功能确实是比较差的，那么做肠镜的检查风险可能会是比较高的，在这种情况下是需要详细评估患者的病情再进一步决定的。还需要评估患者做肠镜检查的必要性，如果患者非常需要做肠镜的检查，进一步评估患者肠道的情况，那么即使存在一定的风险也是需要进一步检查的，以免延误患者的病情。但是如果患者做肠镜的必要性并不大，那么病人胸闷、呼吸困难、气短的情况下是不建议强行做肠镜的。