月经干净两天，这个时间在一起一般是不会怀孕的。正常情况下只有在排卵期的时候同房才容易受孕，排卵期就是下次要来月经的前14天左右，这个时间为排卵期，其它时间为安全期，安全期一般是不会怀孕的。月经刚结束两天这个卵泡才刚开始发育，这个时候卵没有成熟，一般是不会怀孕的。所以月经周期规律的患者月经干净两天，这个时间一般是不会怀孕的，月经周期不规律的患者，一般排卵期也不是在这个时间，只有在排卵期的时候才容易受孕。所以，如果月经规律的患者，一般月经干净两天，这个时间是安全期，不会怀孕。