女性月经不正常是可以影响到正常怀孕的，首先女性月经不正常的时候，常常提示有可能子宫、附件等生殖系统存在一些器质性的病变，比如最常见的粘膜下子宫肌瘤、子宫内膜息肉，可以增加子宫内膜的表面积，并且改变了宫腔里面的环境，可以影响到受精卵的着床，导致女性出现不孕症。

有一些女性并没有生殖系统的一些器质性病变，但是性腺轴的功能发生了异常，比如说卵巢的功能异常，引起激素水平不稳定，或者是甲状腺、肾上腺功能的异常，就可以导致女性出现受孕困难。月经不正常的时候，有一些女性还伴有排卵的障碍，也可以加重不孕症的出现。