甲状腺囊肿一般情况下是不影响怀孕的，因为甲状腺囊肿只是单纯的形态学的改变，也就是甲状腺中发现肿大的囊性的结节。这种结节一般是液性，多数情况下没有功能，所以对怀孕没有什么太大的影响，但是既然甲状腺也会发生这种囊性的结节或者囊肿，那有可能也会存在一定的功能性的表现，也就是说，同时有两种情况，既有囊肿也有甲状腺功能其他的问题，这时候可能就会影响怀孕。所以当发生甲状腺当中，以后在怀孕之前需要进行甲功检查，来判断是否可以怀孕，是否对怀孕有影响。