巧克力囊肿在单纯的切除子宫以后，如果还保留着双侧的卵巢组织，并且卵巢组织里面还存在异位的子宫内膜组织，那么在切除子宫手术后还是有复发的可能。

因此对于卵巢巧克力囊肿手术以后还是需要补充激素治疗，需要采用假孕的疗法，使异位在卵巢里面的内膜组织出现萎缩，从而才可以减少复发的情况出现。

对于女性要使巧克力囊肿绝对的不复发，那么就需要行根治的手术需要切除双侧的卵巢组织，这种情况下就不会再有复发，单纯的切除子宫并不会影响卵巢的功能，因此卵巢巧克力囊肿还是有复发的可能。