甲状腺囊肿有时会疼，有时不会疼。甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现的，含有液体的囊状物，一般是呈圆形，直径一般是在2-5个厘米之间，光滑，一般不疼或者有轻微的疼痛，可以随着吞咽上下移动。

如果囊肿很大或者囊肿内有出血的现象，这时可能会产生一些压迫的症状，比如就会出现疼痛、吞咽困难、呼吸困难、声音嘶哑等情况，因此甲状腺囊肿是否会疼痛，一般是与甲状腺囊肿的大小，和囊肿内是否有出血有关。