咳嗽变异性哮喘和上气道咳嗽综合征的区别，主要是两种疾病不是一个病因引起的。

咳嗽变异性哮喘大部分是由于过敏引起的，比如对空气中的尘螨，或者是花粉等等过敏引起的类似于哮喘的这种疾病；而上气道咳嗽综合征多数是由于鼻子的疾病引起的，比如像鼻腔有了分泌物，它滴到了我们的咽喉部，从而刺激我们的咽喉产生咳嗽的症状。

所以两者在治疗起来也是不一样的，咳嗽变异性哮喘主要是使用一些吸入类的药物，或者是加上激素进行治疗；而上气道咳嗽综合征主要是采用一些麻黄碱收缩鼻黏膜，那么这样的话可以降低分泌物的产生，这样的话也是可以治疗好咳嗽的。