在胚胎发育停止以后也是可以选择做药物流产的，但是要根据具体的情况来看。

如果是胚胎停育时间比较早，是在怀孕49天以内的，而且孕囊的体积不大,2cm的，是可以选择做药物流产的。但是如果是怀孕月份比较大的，胚胎停止发育就不能做药物流产，就需要做人工流产，或者是引产的方式来终止妊娠。在做药物流产的时候，要在正规医院的医生指导下来服用药物才可以。