头顶疼两眼发困有可能和过度劳累、过度疲惫、脑疲劳有一定关系，熬夜、不良的生活方式、不良的饮食习惯、吸烟、酗酒、药物中毒，都可以引起头顶疼、两眼发困。脑动脉硬化、脑血管狭窄、脑梗塞、脑出血、脑血管疾病也可以出现头顶疼两眼发困。所以要积极地进行治疗，监测血压、血脂、血糖，保证充足的睡眠时间，可以进行头颅CT或者头颅磁共振检查，排除脑血管疾病可以药物治疗。