肠套叠的治疗主要是非手术疗法和手术疗法，非手术疗法是采取灌肠治疗，在肠套叠四十八小时之内，全身状况良好，腹部不胀，无明显脱水及电解质紊乱，可以采取B超下水压灌肠、空气灌肠和钡剂灌肠。如果肠套叠超过四十八到七十二个小时，或虽时间不长，但病情严重，已有肠坏死和肠穿孔者，需要进行手术疗法。