在刚怀孕的时候，如果发现有卵巢囊肿，是需要根据卵巢囊肿的大小来决定如何治疗的。一般在有经验的妇产科医生，可以根据临床表现、辅助检查结果判断病情，来制定个体化的方案。孕早期对于卵巢囊肿的评估是比较重要的，有可能会导致流产的发生。如果囊肿是比较小的，也没有影响到胎儿的正常发育，可以密切的观察。但如果卵巢囊肿比较大，对于胎儿的生长发育有可能会造成影响，就要及时的进行手术治疗，在彻底治愈以后再进行怀孕。