当有一些比较小的巧克力囊肿的时候，是可以去做试管婴儿的，但是如果说这个巧克力囊肿比较大，尤其是超过4cm以上的时候，一般通常建议先进行手术剥除囊肿之后，然后再做试管婴儿。这主要是由于当巧克力囊肿比较大的时候，可能会影响取卵，除此之外我们在做巧克力囊肿剥除的时候，同时做通液或者是腹腔的冲洗，可以改变盆腹腔的局部环境，对于做试管婴儿来说，增加成功概率是有好处的。