早晨起床之后小便颜色深黄伴有异味，主要是由于夜间饮水过少，同时加上肾脏在夜间分泌的尿液也会减少，从而导致尿液浓缩而引起的，这种情况属于正常的生理现象，患者一般没有排尿不适症状。

通过多喝水、勤排尿，稀释尿液之后小便颜色就会恢复正常，异味也会逐渐变淡。 如果通过多喝水、勤排尿，小便颜色仍然有深黄伴有异味，同时还伴有排尿不适症状，则需要考虑伴有感染的可能性，应该去医院泌尿外科做尿常规检查，来进行明确。