重症肌无力感染性肺炎的治疗跟普通肺炎是一样的，用细菌感染、病毒感染或者是其他微生物感染的相对应抗生素来治疗。

但是如果是重症肌无力合并肺部感染，氨基糖甙类的药物对神经病肌肉接头的疾病，也就是对重症肌无力有加重的副作用，所以这类药物，还有镇静类的药物不能用，是禁忌，并且加重肌无力的药物也不能用。