临床上鳞状细胞癌的癌种一般根据癌细胞的分化程度不同，分为低分化，中分化和高分化鳞状细胞癌三种类型，其中最为常见的类型是低分化，或者是中分化的鳞状细胞癌，而高分化的鳞状细胞癌临床较为少见。

在预后方面这三种类型的鳞状细胞癌是不同的，低分化的鳞状细胞癌一般恶性程度较高，患者的预后较差，很多患者早期就容易发生淋巴道的转移，或者是血行途径的转移。而高度分化的鳞状细胞癌，其恶性程度是较低的，肿瘤的进展速度较慢，患者的预后较好。而中分化的鳞状细胞癌其预后情况则介于两者之间。