肾结石的患者出现疼痛、尿液变得混浊，需要考虑以下几个方面的原因：

第一个是由于肾脏内的结石位置发生移动，产生了积水。而部分患有肾结石的患者，伴有肾积水，甚至是肾脏的积脓。这种情况下结石位置发送移动之后，积水排出体外，或者是脓液排出体外，会导致小便颜色比较浑浊。

另外一种情况，是由于结石位置发生移动之后，损伤了泌尿系统的黏膜，导致少量的出血。血液混入尿液之后，使得小便颜色看起来比较浑浊。最好是能够做个尿液常规检查，进行明确。