临床上使用雌三醇是用来检测孕妇的胎盘功能，当胎盘功能不良、胎盘、硫酸酯酶缺乏症以及妊高症影响了子宫的胎盘血液循环者，均可导致雌三醇的数值下降。

雌三醇还可以监测高危妊娠的患者，雌三醇如果继续的上升，提示妊娠未足月，若几次的监测均在同一水平，考虑已经足月妊娠。同时通过雌三醇的检测，可以协助诊断胎儿的疾病，如胎儿宫内生长发育迟缓，因为孕妇吸烟过多或者营养不良而影响，雌三醇的水平也有下降的情况。