宝宝便秘的常见原因分为器质性和功能性的，一般来说器质性的病因，包括本身肠管的一些器质性病变，直肠、肛门病变，还有一些内分泌或者代谢性疾病等，还有一些神经系统疾病，还有肠管平滑肌或神经源性便秘。还有神经性心理障碍，药物性因素等。

不过大部分还是功能性的便秘，功能性便秘病因尚不是很明确，其发生可能跟这些因素有关，第一个、进食量少或食物缺乏纤维素，或者水分不足，对结肠运动的刺激减少。还有就是可能宝宝情绪比较紧张，一些精神因素干扰了正常的排便习惯，腹肌或者盆肌的肌张力不足，排便推动力不足，难以将粪便排出体外。另外可能是滥用了泻药，形成了药物的依懒性等。