乳腺囊肿如果是恶性的，建议依据病理结果决定治疗方案，也需要依据患者病情，多学科协作制定一个个体化的综合治疗方案，包括是否要行乳腺改良根治术，还是保乳手术，术后根据病理的情况来制定化疗、放疗、内分泌治疗。

如果内分泌治疗结合后，免疫组化提示Her-2强阳性，需要实行分子靶向治疗，分子靶向治疗对于乳腺癌Her-2阳性现在能达到70%以上。