川崎病为自限性疾病，大多数预后较好，如果没有冠状动脉病变，停药后必须在出院后一个月、三个月、六个月，以及一至两年进行一次全面的检查，包括体格检查、心电图和超声心动图的检查，部分有冠状动脉瘤的患者，随访时间必须更长，每6-12个月随访一次，大部分冠状动脉瘤病后两年内自行消失，少部分可能遗留血管壁增厚和弹性减弱等功能的异常。