眼睛痛了两个月不好需要通过以下方式治疗：

第一，由于病毒性角膜炎引起的，需要在眼部点抗病毒的滴眼液治疗，例如更昔洛韦滴眼液、干扰素滴眼液等，同时还需要点促进角膜修复的药物治疗，例如重组人表皮生长因子滴眼液、硫酸软骨素滴眼液等。

第二，由于倒睫造成的，需要将倒睫拔掉或者做电解倒睫治疗才能够缓解症状。

第三，由于虹膜睫状体炎造成的，需要在眼部点激素滴眼液治疗才能够消除炎症，例如常用的由妥布霉素地塞米松滴眼液等。

第四，由于角结膜干燥症造成的，需要通过眼部使用温毛巾热敷加速泪液分泌，以及点人工泪液滴眼液为眼睛补充水分治疗来缓解症状，常用的有玻璃酸钠滴眼液，聚乙二醇滴眼液等。

（用药请遵医嘱）