小孩甲流高烧39度，在短期内对身体没有很大的影响，如果持续高烧，应该做好及时降温处理，否则有可能容易导致高热惊厥，对身体会造成一定的影响。所以对于甲流的孩子，如果高烧超过38.5摄氏度，需要及时的使用退热药物，进行降温处理。同时可以配合物理降温，比如多喝开水、额头贴退热贴、脖子、腋下、腹股沟区用温水擦浴。如果效果不好，可以配合物理降温的同时，口服退热药物，比如对乙酰氨基酚混悬液、布洛芬混悬液。

（药物的使用，需要在专业医生的指导下进行。）