肉芽肿和肉芽组织，两者是有本质的区别的。肉芽肿是指在组织发生了炎症以后，巨噬细胞及其演化的细胞，在局部增殖所形成的一个结节样的肿物。临床上称作肉芽肿，实际上他是炎症的后果。

而肉芽组织，常常发生在伤口的愈合当中，在伤口内出现毛细血管和成纤维细胞，构成了一个鲜红的组织。因形似肉芽临床上称作为肉芽组织，其实它是在伤口愈合的过程当中，所形成的一种特殊的组织，所以这就是两者最主要的区别。