菌血症一般是没有后遗症的，菌血症主要是由于细菌感染，细菌释放出内毒素导致患者出现全身性的炎症反应，严重的话有可能会出现感染性的休克，对于菌血症的治疗一般是加强抗感染治疗，如果能够找到原发的感染病灶，要行外科手术将原发灶进行切除，或者是在超声或者介入下，行腹腔穿刺或者是胸腔穿刺、置管引流等等，同时需要加强换药，一般要选用针对性的抗生素来抗感染治疗，假如患者在治疗过程中病情康复了，一般不会留有后遗症。