乳腺钼靶和乳腺核磁共振各有优缺点，总的来说，乳腺核磁共振的优点要大于乳腺钼靶。首先，核磁共振可以显示钼靶比较难显示的致密型腺体、乳腺癌术前及术后评估和治疗效果等情况。第二，乳腺钼靶只能够显示斜位和轴位的病变，而乳腺核磁共振可以任意方位的呈像，使病灶检出率更加清楚，尤其是位于深部的病灶。乳腺不及钼靶的主要缺点是对显示钙化不如钼靶，而且磁共振检查时间长有一定的呼吸运动伪影的存在。