CT检查没事，但还是头痛，原因很多。首先CT可以检查脑肿瘤、脑血管性病变，比如海绵状血管瘤、动静脉畸形、脑梗塞、脑出血、脑外伤性改变，比如硬膜下血肿、硬膜外血肿、蛛网膜下腔出血等情况都可以在CT上有阳性的表现。

有些情况CT是阴性的，比如高血压引起的头痛、偏头痛及紧张性头痛、枕大神经痛、青光眼引起的头痛、急性脑炎和脑膜炎引起的头痛。当CT发现是阴性，而头痛还存在的时候，需要进一步结合临床病史及相关的检查来完善诊断。