盐水洗鼻子的副作用通常较轻微，最常见的可能是由于操作不当造成鼻腔前端的粘膜出现损伤，引发患者鼻子出血。

盐水洗鼻子主要的治疗作用在于对慢性鼻窦炎以及鼻息肉、过敏性鼻炎的患者，清理患者的鼻腔，使粘稠的分泌物更加利于排出鼻腔，从而改善患者鼻塞、流脓鼻涕以及鼻痒等相关的症状。另外，对于盐水洗鼻的患者，还应该在洗过以后注意保暖，避免受凉感冒，以免造成鼻腔分泌物再次增多。