婴儿拉肚子发烧通常提示有感染，而感染引起的婴儿拉肚子中80%以上属于肠道病毒感染，如轮状病毒感染、诺如病毒感染、柯萨奇病毒感染等，这些占了绝大部分，还有少部分孩子可能是有肠道细菌感染引起的，有侵袭性细菌感染，也有产毒性细菌感染，因此，致病机理是不一样的。

第三个方面，还有可能出现真菌感染或者其他的寄生虫等感染，这种情况通常介于有基础性疾病长期拉肚子的宝宝，因此，宝宝拉肚子又发烧，应该积极就诊检查，针对病因进行治疗。