婴幼儿腹泻原因通常分为内因和外因，内因是因为婴幼儿消化系统发育还不成熟，机体防御功能差，人工喂养较为多，而且其肠道微生态系统平衡尚在不断完善中。那么引起小儿腹泻，婴幼儿腹泻的外因通常是非感染因素占绝大部分，表现为喂养及护理不当、食物过敏、食物不耐受，以及消化吸收不良，还有与抗生素相关。另外，少部分为感染因素。感染因素中80%为肠道内病毒感染，比如，人造病毒、若如病毒、艾柯病毒、柯萨奇病毒、腺病毒感染等等，少部分为肠道内细菌感染、真菌感染、寄生虫感染。还有部分孩子为肠道外感染消化道的症状，比如上呼吸道感染、肺炎、败血症之后出现小儿腹泻。