婴儿腹泻的病因很多，绝大部分属于非感染性的因素，常见于饮食结构不合理、牛奶蛋白过敏、乳糖不耐受、喂养不当或者是天气的原因、消化不好，这些因素都是很常见的。除此之外，就是感染性的因素，在感染性的因素中，80%以上属于病毒感染性的疾病，如轮状病毒感染、诺如病毒感染等等，其次有少部分为细菌感染引起，还有很少一部分是由肠道寄生虫，甚至真菌感染引起。