输尿管结石发生肾功能不全的原因，可能是患者存在双侧的输卵管结石，而且输尿管内的结石迁登于输尿管管壁，导致双侧的肾脏内的尿液不能够排出，导致肾积水的发生，从而引起肾功能不全。出现这种情况，应该立即手术治疗，将输尿管内的结石碎掉，引流肾脏内的尿液，从而改善肾功能。