通常情况下，腰椎穿刺属于种诊断性操作规程，主要是用于诊断中枢神经系统的一些疾病，比如中枢神经系统性感染、颅内感染以及一些出血性疾病、脊髓病变等。或者怀疑有中枢神经系统占位性病变，包括用于诊断不明的神经系统疾病，都需要用到腰椎穿刺。

另外，一些特殊的检查，比如气脑或者是椎管造影，也需要通过腰椎穿刺来进一步进行检查。同时，部分患者患有严重的颅内感染，需要通过腰椎穿刺放出脓性积液，以及通过腔内注射抗生素来进行治疗。