女性在患有输卵管囊肿的时候是会影响到正常怀孕的，因为输卵管囊肿会影响到输卵管，造成输卵管狭窄堵塞，这样就会影响到卵子和精子的结合，以及受精卵的运行，这样还容易发生有输卵管妊娠，所以对于怀孕造成的影响是比较大的。在患有输卵管囊肿的时候，一定要及时的到医院进行手术的治疗，发生输卵管囊肿大多是由于输卵管炎症所造成的输卵管积水，或者是发生的一些炎症性的改变，而发生输卵管堵塞，所以可以通过药物治疗或者是手术治疗。