羊水穿刺和无创DNA是孕期用于检查胎儿是否存在染色体畸形的重要手段，但是这两者有很大的区别。无创DNA是产前筛查，而羊水穿刺是产前诊断，这就说明无创DNA所给出的结论是一种风险，而羊水穿刺说给出来的结论是一种确诊性质的结论，这两者的区别包括以下几方面：

第一，检测的范围不一样，无创DNA只能检测一部分染色体异常，而羊水穿刺可以检测出所有的染色体异常；

第二，无创DNA给出的结论是高风险或低风险，而羊水穿刺直接给出胎儿到底有没有染色体畸形。所以，羊水穿刺的全面性和准确性要高于无创DNA。