在患有卵巢囊肿的时候能不能怀孕，是要根据卵巢囊肿的大小，以及其性质来看的。卵巢囊肿可以分为良性和恶性，如果是良性的卵巢囊肿，一般对于正常的生育是影响不大，可以进行怀孕的，有些卵巢囊肿是生理性的，随着月经周期的变化，卵巢囊肿也会自然地消失，所以在患有卵巢囊肿的时候，要定期的观察，如果患者患的卵巢囊肿体积比较大，或者经过检验是恶性的卵巢囊肿，建议患者要积极的治疗以后看情况再选择怀孕。