甲状腺结节的病因有很多，可以分为良性和恶性两大类。甲状腺结节可以分为一，增生性结节性甲状腺肿，就是由于各种原因，包括碘过高，也包括碘过低，或者是服用致甲状腺肿的药物导致甲状腺滤泡上皮增生，形成结节。

第二类，是肿瘤性结节，可以有甲状腺良性肿瘤，也可以有甲状腺髓样癌、未分化癌、滤泡细胞癌等恶性肿瘤所导致的结节。

第三类，囊肿，可由结节性甲状腺肿、腺瘤退行性变、陈旧性出血导致囊肿形成。

第四类，是炎症性结节，表现为为急性化脓性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎或者慢性淋巴细胞性甲状腺炎，都可以形成结节。