桥本甲状腺炎是甲状腺炎中最常见的临床类型，90%以上发生于女性。桥本甲状腺炎也是原发性甲状腺功能减退症最主要的原因，目前认为桥本甲状腺炎是由遗传和环境因素，共同作用而引起的自身免疫性甲状腺疾病。其发病原因并没有完全彻底地阐明，目前认为桥本甲状腺炎属于一种多基因遗传病，其致病的关键是自身免疫。桥本甲状腺炎可与其他自身免疫性疾病，如干燥综合征、系统性红斑狼疮等同时存在。此外，桥本甲状腺炎的发病机制中，还可能含有遗传因素和环境因素，有研究表明高碘摄入，也是桥本甲状腺炎发病的一个重要的因素。