亚甲炎是一种自限性的疾病，预后是比较好的。所以对于轻型的亚甲炎的患者，仅需使用非甾体类的药物治疗；对于中重度的患者，可以给予糖皮质激素的治疗，能够缓解甲状腺的疼痛；对于少数复发之后的，也还是可以继续口服糖皮质激素治疗；针对有甲状腺毒症的患者，是可以使用控制心率的一些药物。但是并不需要用到抗甲亢的药物，或者是补充甲状腺激素水平的药物来治疗的，因为它是一个自限性的疾病，它的病理过程就是甲亢期、甲减期，然后再到甲状腺功能正常恢复期。

（具体用药，需在医师的指导下进行）