绝大多数慢性肾小球肾炎，是由不同的病因，和不同病理类型的原发性肾小球疾病发展而来。仅仅少数是由急性链球菌感染后，肾小球肾炎所致。其主要的发病机制，是一种免疫反应介导的炎症损伤。当然，还有一些非免疫、非炎症因素，参与到慢性肾炎的进展中。其中包括高血压、蛋白尿、高脂血症等等。此外，像一些遗传的因素，和免疫遗传因素，在肾小球肾炎中的作用，也慢慢得到了重视。