单纯性的右肾囊肿，通常是没有症状的，但是当囊肿增大到一定程度的时候，可能会引起腰胀、腰痛这些症状。当囊肿压迫引起血管闭塞或者是尿路梗阻时，可以出现血尿、腰痛、感染等等其他的症状。

现在有研究表明，单纯性肾囊肿患者会出现红细胞的异常。一般认为单纯性的肾囊肿并不影响肾功能，但是最近有研究显示，有肾囊肿的患者比无肾囊肿患者有较高的血肌酐水平，而且囊肿数量越多，血肌酐水平越高。因此，可能对于单纯性的肾囊肿患者也应该长期随访。