目前肠镜检查有无痛肠镜以及普通肠镜之分，无痛肠镜是指患者在麻醉状态下进行肠镜检查，这种情况患者是没有任何感觉的，也就没有痛苦。普通肠镜是患者在清醒的状态下插管检查，这种情况大部分患者，或多或少都有不同的不适症状，一般是以胀痛或者呕吐为主。

一般来说，瘦长型患者或者腹部有手术史的，往往形成肠道排列紊乱，操作起来相对比较困难，所以痛苦也比较大，矮胖型患者肠道相对固定，操作起来容易，所以痛苦也相应较少。