卵巢囊肿在五公分的时候，那么既具备了手术的指征，手术主要是切除卵巢囊肿。第一可以，完整切除卵巢囊肿组织。第二，还可以将卵巢囊肿组织送病理学检查。因为卵巢囊肿具有多种类型，多种可能性。在进行病理检查时，可明确卵巢囊肿是哪一种类型，并根据不同的卵巢囊肿类型，来进行术后的一系列追加治疗。因此，如果卵巢囊肿五公分，那么建议患者立即就医。