脑干梗塞之所以出现眼睛斜，可能会因为支配眼球运动的脑组织出现坏死，所以出现眼睛斜，引起眼球运动障碍，所以眼球运动不协调而出现眼睛斜，那么这种情况主要还是治疗脑干梗塞。脑干梗塞也是脑梗死的一种，只是梗塞部位在脑干，那么急性期病情也是有可能加重的，所以急性期主要是住院治疗，同时要查一下既往是否有高血压、糖尿病等危险因素，还要查一下血管状态来指导预后。如果急性期过后，可以通过一些理疗慢慢得到恢复，但是也是有可能留有后遗症的。急性期过后出院之后，可能还要根据医生的指导下来用药。（具体药物使用请在医生指导下进行，不要擅自用药）