骨囊肿在临床上很少癌变，因为骨囊肿是一种瘤样病变，并不是癌症，所以骨囊肿基本上是不会癌变的。那么，有一种情况可能出现，比如有一部分骨囊肿做完手术以后，又进行复发了。如果这种反复的复发，反复手术就可能出现癌变，但是这种几率是非常低的。

如果骨囊肿通过手术治疗，把囊肿全部清除了干净，包括切除了部分的正常的骨质以后，它的复发的几率也是相当低的。所以只有在这种反复手术，反复发作的病人才可能会癌变，但是所占的机率是非常低的。因此，在临床上骨囊肿大部分的都不会癌变。